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構建帶有UMT的Illumina NGS文庫
更新時間:2020-11-10 點擊次數:1073
構建帶有UMT(Unique Molecular Tags)的Illumina NGS文庫 |
ThruPLEX® Tag-seq Kit |
· 可信賴的實驗結果。ThruPLEX Tag-seq 技術提供了多達1,600萬個分子標簽來糾正測序誤差, 提供可信的變異檢測分析。 · 發現更多,成本更低。結合基于雜交技術的目標序列富集系統可分析數百個基因,同時分析突變和結構變異。 · 每次都可獲得高質量文庫。單管操作,2小時,3步操作流程。使用簡便,可減少使用者操作誤差和污染發生。 · 省時的生物信息學分析方案。采用Curio Genomics提供的云服務軟件或開源軟件可以快速獲得 研究結果。 · 珍貴樣品分析成為可能。更低的DNA起始量,以往由于起始量太低而不能分析的樣品也可以分析了。 ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多種樣品類型。 |
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■ 產品說明: |
ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標簽(UMT)的ThruPLEX引物構建帶有分子標記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫。每個試劑盒包含超過1,600萬個特別序列用于在擴增前標記每條DNA小片段,可以在文庫制備、目標富集和數據分析過程中追蹤DNA小片段,以檢測低豐度等位基因或計數獨立片段。采用ThruPLEX 技術設計及優化,可以1到50 ng DNA起始構建高多樣性、高重復性文庫。整個流程在單管或單孔中就可完成,只需3步,2小時,無需中間純化步驟和樣品轉移,避免了操作誤差和樣品損失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑,包括可以多重標記96個樣品的檢索引物。純化和定量后,文庫可以采用標準Illumina測序試劑和流程在Illumina NGS平臺進行測序。 |
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圖1. 單管,三步操作流程。 ThruPLEX Tag-seq Kit以1-50 ng DNA起始構建檢索引物文庫只需3步:末端修復,接頭連接和高保真文庫擴增。無需純化和樣品轉移步驟。簡化的工作流程,在單管或單孔中2個小時即可完成,避免樣品損失,增強了陽性識別。 |
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圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術概要。ThruPLEX技術以片段化雙鏈DNA或游離DNA起始,只需3步反應,簡單高效。 |
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圖3. 減少背景,結果更可靠。以30 ng 1% Horizon cfDNA standard,采用 ThruPLEX Tag-seq構建文庫。Agilent SureSelect富集目標區域,~5,000X覆蓋度測序,采用Curio Genomics生物信息學平臺分析數據。采用原始數據分析,EGFR 的突變(黃色點)會被背景誤差遮蓋(左圖)。而在數據分析過程中使用UMT修正誤差,突變更容易識別(右圖)。 |
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圖4. 顯著提高信噪比,發現更多。以30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq構建文庫,240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目標區域,HiSeq 2500 ~5,000X覆蓋度測序。Curio Genomics生物信息學分析平臺進行數據分析。 *數據來源于Takara Bio Inc. |
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■ 產品組成 |
· Template Preparation Buffer (Red) · Template Preparation Enzyme (Red) · Library Synthesis Buffer (Yellow) · Library Synthesis Enzyme (Yellow) · Library Amplification Buffer(Green) · Library Amplification Enzyme(Green) · Nuclease-Free Water(Clear) · Indexing Reagent |
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■ 保存 |
-20℃ 訂購信息 TAKARA | R400584 | ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit | 12 Rxns | TAKARA | R400585 | ThruPLEX Tag-seq 48S Kit | 48 Rxns | TAKARA | R400586 | ThruPLEX Tag-seq 96D Kit | 96 Rxns |
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